基于DNA堿基之間的互補(bǔ)配對(duì)原則可以設(shè)計(jì)組裝多種復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu),進(jìn)而開發(fā)出具有特定功能的DNA分子器件,包括分子開關(guān)、納米機(jī)器、分子框架、邏輯電路等。這些分子器件不僅在生命科學(xué)研究領(lǐng)域內(nèi)發(fā)揮著重要作用,并在能源、信息、生物計(jì)算等研究領(lǐng)域均有重要意義。DNA邏輯門是將DNA等生物分子或其他外界信息作為輸入(input),通過DNA結(jié)構(gòu)變化引發(fā)的各種表征結(jié)果作為輸出(output),布爾運(yùn)算后可以使得各種輸入之間的相互識(shí)別關(guān)聯(lián)關(guān)系得以明確。此外,通過將前一個(gè)邏輯門的輸出作為后一個(gè)邏輯門的輸入,可以構(gòu)建多個(gè)級(jí)聯(lián)的邏輯門,即邏輯電路。邏輯電路的組合、信號(hào)輸出方式具有多樣化的特點(diǎn),有廣泛應(yīng)用前景。

中國科學(xué)院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所研究員繆鵬課題組發(fā)展出一種基于DNA雙足步行的電化學(xué)納米機(jī)器,并通過級(jí)聯(lián)鏈置換構(gòu)建出系列DNA邏輯電路,用于研究復(fù)雜生物樣本中多種生物分子的關(guān)聯(lián)關(guān)系。研究首先在電極界面修飾莖環(huán)結(jié)構(gòu)的軌道探針分子;在上游均相體系中引入目標(biāo)觸發(fā)的鏈置換聚合反應(yīng),用于特定序列單鏈的大量合成;利用DNA三通結(jié)結(jié)構(gòu)完成雙足步行鏈的組裝;在莖環(huán)結(jié)構(gòu)驅(qū)動(dòng)鏈的存在條件下使其在電極界面交替行走,完成電化學(xué)信號(hào)分子的富集探測(cè)(圖1)。進(jìn)一步地,科研人員利用不完整三通結(jié)及雙鏈結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì),進(jìn)行級(jí)聯(lián)鏈置換反應(yīng)構(gòu)建出AND、OR門,并與NOT門聯(lián)合發(fā)展出NAND、NOR、XOR、XNOR門。研究構(gòu)建的雙輸入邏輯電路表現(xiàn)出良好的邏輯運(yùn)算、操作性能(圖2)。隨后,科研人員通過四通結(jié)及雙鏈結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)完成了三輸入AND、OR門的搭建。該系列邏輯電路不僅可應(yīng)用于超靈敏生物醫(yī)學(xué)檢驗(yàn),也可為生物分子信息控制、通信、生物計(jì)算機(jī)等領(lǐng)域的研究工作提供新思路。

相關(guān)研究成果發(fā)表在ACS Central Science上。研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金等的資助。

圖1.DNA雙足步行器的示意圖及結(jié)果

圖2.雙輸入的邏輯電路示意圖及結(jié)果

圖3.三輸入的邏輯電路示意圖及結(jié)果

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