人工智能在開發(fā)新藥以及識別現(xiàn)有藥物的新應(yīng)用方面發(fā)揮著越來越重要的作用。例如,人工智能可以用于更快地找到新分子,并通過篩選最有可能對治療產(chǎn)生反應(yīng)的患者,來改善臨床試驗。
大型藥企正在探索利用人工智能賦能藥物開發(fā),力求通過AI技術(shù)快速尋找臨床試驗患者,或減少測試藥物所需的人員數(shù)量,從而既能加快藥物開發(fā),又能節(jié)省數(shù)百萬美元的成本。盡管目前FDA還沒有批準(zhǔn)AI發(fā)現(xiàn)的藥物,但對生成式AI的興趣可能會在未來幾年改變制藥行業(yè)的游戲規(guī)則。
法國制藥公司賽諾菲(Sanofi)5月21日宣布,與ChatGPT創(chuàng)始公司OpenAI以及美國生物技術(shù)公司Formation?。拢椋锝⒑献骰锇殛P(guān)系,以加快人工智能在藥物開發(fā)中的應(yīng)用。近年來,賽諾菲在人工智能方面已經(jīng)與Owkin、Exscientia、Insilico?。停澹洌椋悖椋睿?、Amunix?。校瑁幔颍恚幔悖澹酰簦椋悖幔欤?、Atomwise和Aqemia等生物技術(shù)公司進(jìn)行了合作。
關(guān)于最新公布的合作,賽諾菲在聲明中表示:“三個團(tuán)隊將匯集數(shù)據(jù)、軟件和調(diào)優(yōu)模型,在整個藥物開發(fā)生命周期中開發(fā)定制的、專用的解決方案。賽諾菲將利用這一合作伙伴關(guān)系,提供專有數(shù)據(jù)訪問權(quán)限,以開發(fā)AI模型,繼續(xù)向成為首家由人工智能大規(guī)模驅(qū)動的生物制藥公司邁進(jìn)?!?/p>
根據(jù)合作協(xié)議,賽諾菲將提供專有數(shù)據(jù)來開發(fā)AI模型,OpenAI將提供先進(jìn)的AI能力和專業(yè)知識,Formation?。拢椋飳⑻峁┢涔こ藤Y源和技術(shù)驅(qū)動的開發(fā)平臺。目標(biāo)是創(chuàng)建定制的AI代理(自動化的AI支持程序)和模型,以滿足制藥行業(yè)需求。
賽諾菲首席執(zhí)行官Paul?。龋酰洌螅铮钤凇。蹋椋睿耄澹洌桑睢∩习l(fā)表文章指出,該聯(lián)盟將“利用我們?nèi)夜靖髯缘膬?yōu)勢,開發(fā)新一代定制化的人工智能解決方案,旨在提高生產(chǎn)率并加速藥物開發(fā)生命周期”。Hudson特別提到,人工智能“已經(jīng)成為賽諾菲許多科學(xué)家的日常現(xiàn)實(shí)”。新的合作伙伴關(guān)系旨在 "通過為整個藥物開發(fā)建立新的基礎(chǔ),從而更進(jìn)一步"。
與此同時,Formation?。拢椋锸紫瘓?zhí)行官Benjamine Liu也向媒體表示,通過整合三家公司的資源,“能夠重新構(gòu)想制藥行業(yè)的藥物開發(fā)”。OpenAI 首席運(yùn)營官?。拢颍幔洹。蹋椋纾瑁簦悖幔稹∫舱劶傲巳斯ぶ悄茉诩铀偎幬镩_發(fā)方面的巨大潛力,他對與賽諾菲和?。疲铮颍恚幔簦椋铮睢。拢椋锏暮献鞅硎九d奮,希望“通過將新藥推向市場來幫助患者及其家庭”。
賽諾菲、Formation?。拢椋铩『汀。希穑澹睿粒伞《颊J(rèn)為,這一合作將改變制藥行業(yè)的游戲規(guī)則。通過將各自在數(shù)據(jù)、人工智能技術(shù)和藥物開發(fā)方面的專長相結(jié)合,他們的目標(biāo)是徹底改變新藥的發(fā)現(xiàn)和上市方式。
日前,生命科學(xué)領(lǐng)域還出現(xiàn)了許多開源和專有的生成式AI工具,例如:
BioMistral:一個開源的大型語言模型集合,以來自 PubMed?。茫澹睿簦颍幔臁〉纳镝t(yī)學(xué)數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)進(jìn)行訓(xùn)練,其中包括幾個?。罚隆?shù)模型,在醫(yī)學(xué)問題解答和多語言能力方面表現(xiàn)出色。一篇預(yù)印本介紹BioMistral?。罚率恰耙粋€專門為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域量身定制的LLM”。
SciBite?。茫瑁幔簦簮鬯嘉栕庸荆樱悖椋拢椋簦逋瞥隽耍樱悖椋拢椋簦濉。茫瑁幔?,這是一款為生命科學(xué)研究人員提供的基于生成式AI的搜索工具。通過結(jié)合語義搜索、生成式AI(包括支持OpenAI的GPT-4模型)以及結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)本體和精選詞匯表,旨在簡化生物醫(yī)學(xué)研究,同時將不準(zhǔn)確輸出的風(fēng)險降至最低。愛思唯爾SciBite的本體管理負(fù)責(zé)人Jane?。蹋铮恚幔┦吭谧罱囊淮尾稍L中表示:“我們將LLM、生成式AI與我們的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)相結(jié)合,你既能提出自然語言問題,又能在幕后使用結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進(jìn)行解釋。因此,你可以獲得兩全其美的效果?!?/p>
Nach0:Insilico Medicine公司和英偉達(dá)還共同開發(fā)了一種新型大型語言模型(LLM)轉(zhuǎn)換器——nach0,它在生物醫(yī)學(xué)和化學(xué)任務(wù)之間架起了一座橋梁。Nach0在不同的數(shù)據(jù)集上進(jìn)行訓(xùn)練,包括PubMed摘要、描述和分子結(jié)構(gòu)等,使其能夠執(zhí)行自然語言處理、化學(xué)相關(guān)任務(wù)和跨領(lǐng)域任務(wù)?;谟ミ_(dá)BioNeMo 生成式AI平臺,Nach0 在分子任務(wù)方面的表現(xiàn)優(yōu)于其他 LLM,并顯著超越了 ChatGPT。案例研究表明,Nach0 能夠生成具有潛在治療活性的分子,并為藥物化學(xué)家驗證有前景的方案。
早些時候,Insilico還推出了?。校颍澹悖椋铮酰螅常牵校裕@是一種高度多模態(tài)、多組學(xué)和多物種的轉(zhuǎn)換器模型,專為老齡化研究、藥物發(fā)現(xiàn)、慢性病研究和生物標(biāo)志物的開發(fā)而研發(fā)。
AlphaFold?。常海桑螅铮恚铮颍穑瑁椋恪。蹋幔猓蟆『汀。模澹澹穑停椋睿洹≡诒驹鲁跬瞥龅摹。粒欤穑瑁幔疲铮欤洹。骋矀涫荜P(guān)注。該模型可以精確地模擬生物分子復(fù)合物的結(jié)構(gòu),包括蛋白質(zhì)、核酸、DNA、RNA、小分子、離子和修飾殘基,采用新穎的擴(kuò)散架構(gòu),可以預(yù)測原始原子坐標(biāo)。
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